一款開放原碼、基於網站的平台,用於資料密集的生醫與遺傳研究 — 現已成為一種可供存取的「雲端運算」資源。一個包括 Anton Nekrutenko(賓州州立大學生物化學與分子生物學副教授)、Kateryna Makova(賓州大生物學副教授)、與來自 Emory 大學的 James Taylor 的團隊,開發出這種新技術,將幫助科學家與生醫研究者駕馭如 DNA 定序及分析軟體這樣的工具,以及大量科學資料的儲存能力。開發細節將在 Nature Biotechnology 期刊上以一篇通訊(letter)的形式發表。
早先由 Nekrutenko 與共同作者所完成的論文,描述這項技術以及它的使用,已發表在 Genome Research 與 Genome Biology 期刊中。
Nekrutenko 表示,他與他的團隊首先在 2005 年開發出 Galaxy computing system (http://galaxyproject.org) ,因為「生物學處於休克狀態」。生物化學與生物實驗室產生堆積如山的資料,然後科學家納悶,「我們現在該做什麼?這些資料我們該如何分析?」 Galaxy(那在賓州大開發並持續使用該大學的伺服器作為其運算力來源)解決了許多問題,這些問題研究者得要將各種工具兜在一起才能使大量資料的檢索與分析更容易,簡化了基因組分析的過程。如同在該團隊其中一篇刊載於 Genome Research 期刊之早期論文所描述的,Galaxy 「將現有基因組註記(genome-annotation)資料庫的力量與一個簡單的入口網站結合起來,讓使用者能夠搜尋遠端資源,從獨立查詢結合資料,並將結果視覺化。」 Galaxy 也能讓其他研究者能夠複審已經完成的步驟,例如,在一串遺傳密碼的分析中。「Galaxy 提供科學的透明度 — 創造出一份分析之公開報告的選項。故,在論文發表後,其他實驗室的科學家能進行研究以重現所敘述的結果,」Nekrutenko 表示。
「除了顯而易見的以外,例如:對於大量資料的運算能力、科學家不必經過太多電腦訓練就能夠使用 DNA 分析工具,Galaxy Cloud 還提供諸多優勢,」Nekrutenko 表示。「例如,研究者不需要投資昂貴的電腦基礎建設,就能夠完成資料密集、複雜的科學分析。」
Galaxy Cloud 另一項優勢在於其資料儲存能力。利用 Amazon Web Services 雲,研究者可以選擇將龐大的資料儲存在安全的地點。「目前正在浮現的技術,其所產生的資料將比現有的『次世代』 DNA 定序多出百倍,那已經到了儲存本身就成為一個問題,更遑論分析的地步了,」Nekrutenko表示。
關於綠建築的標準,讓我們先回到 1990 年,當時英國建築研究機構(BRE)首次發布有關「建築研究發展環境評估工具(Building Research Establishment Environmental Assessment Method,BREEAM®)」,是世界上第一個建築永續評估方法。美國則在綠建築委員會成立後,於 1998 年推出「能源與環境設計領導認證」(Leadership in Energy and Environmental Design, LEED)這套評估系統,加速推動了全球綠建築行動。
男性和女性的 DNA 差異極小,僅限於在女性身上為X或男性為Y的那單一染色體。姊弟或兄妹從完全相同的來源取得基因,透過重組母親和父親的 DNA,確保兄弟姊妹絕對不會相近到變成複製人。
性別分化過程大部分要歸結到 Y 染色體上的「SRY 基因」,它的全名是「Y 染色體性別決定區基因」。若要說有「運動能力基因」,那就非 SRY 基因莫屬了。人類生物學的安排,就是讓同樣的雙親能夠同時生育出男性的兒子和女性的女兒,即使傳遞的是相同的基因。SRY 基因是一把 DNA 萬能鑰匙,會選擇性地啟動發育成男性的基因。
身體的能量大多由細胞裡的能量工廠產生,也就是粒線體。這種能量以 ATP 的形式存在,用來驅動體內種種的生物過程,維持新陳代謝。攝取果糖後,身體會產生尿酸,對能量工廠造成氧化壓力,導致 ATP 產量減少,最後果糖所含的熱量會以脂肪和肝醣的形式儲存在體內。這個過程能幫助我們儲備能量,以因應食物不足的狀況。