這兩天所有的新聞都繞著511打轉，其實有個還蠻特別的事情想要提出來跟大家分享。

上面這個新聞是昨天的事情，有幾個竹科的員工吃了「印尼風味麵」以後，得了傷寒；結果發現病菌的來源是麵店的印尼籍老闆娘。

特別的是這位老闆娘本身並沒有症狀，但是採取檢體發現她就是病菌的來源，是所謂的無症狀帶原者。

這樣的事情對其他的疾病可能不常見，但對於傷寒來說卻早已不是新聞了。20世紀初的傷寒瑪麗(Mary Mallon)就是一位無症狀帶原者，終其一生她把傷寒傳染給了超過50個人，其中有3個人死亡。

美國政府在發現她是帶原者後，曾經將她隔離過一段時間，當時並沒有抗生素這種東西，所以隔離就僅能將她跟人群隔開，卻不能殺死她體內的病菌；一段時間後將她釋放，並要求她不能在從事原來的職業（廚師）。但不久後她又重操舊業（因為找到的新工作薪水低），再度將傷寒傳染給更多人。

後來美國政府只能選擇將她終身隔離，這對她當然頗不公平，但好像也沒有辦法。現在有抗生素，我們的這位新住民會被隔離後投藥，並定期檢查直到連續三次採樣都沒有病菌，她就可以再過正常人的生活了。

其實歷史上除了「傷寒瑪麗」以外，還有「傷寒東尼」；傷寒東尼的病菌感染了大約100個人，比瑪麗的威力更大！但由於瑪麗是第一位無症狀帶原者，所以大家都只記得瑪麗。

瑪麗是愛爾蘭移民，除了小時候得過一次傷寒以外，終她的一生她始終都沒有再度發展出傷寒的病狀。由於當時社會對於愛爾蘭移民的偏見，她始終都認為美國政府將她隔離是一種對她的迫害，也一直都拒絕接受採樣。

傷寒(typhoid fever)是由沙門氏桿菌傳染，為格蘭氏陰性桿菌，學名是Salmonella enterica enterica 的 Typhi血清型（有時被直接寫成Salmonella typhi）。 傷寒桿菌有許多血清型，通常在發現可能的病例後進行細菌培養，第一步要作的就是鑑定血清型。由於傷寒是法定傳染病，鑑定完血清型確認後就要通報疾病管制局。

傷寒一開始會發燒，發燒可以到40度，伴隨著頭痛跟疲倦，這個階段常常會被誤以為是感冒。如果沒有治療，第二週開始除了繼續發燒以外，還會胡言亂語（譫妄）、腹瀉、玫瑰疹，第三週症狀到達最嚴重的階段，可能會有腸出血、腸穿孔（可致死），如果可以熬過這週，第四週可望慢慢恢復。但恢復後約有5%成為無症狀帶原者，他們不會再出現傷寒的症狀，但會排出傷寒桿菌，造成他人感染。如果沒有治療，致死率大約在10%-30%之間。

沙門氏桿菌與大腸桿菌(Escherichia coli)是近親，它們都有很多血清型(serovar)，有些血清型會導致很嚴重的疾病。沙門氏桿菌裡面比較出名的就是傷寒桿菌，而大腸桿菌中最有名的是O157型，它可以導致出血性腹瀉。這兩隻細菌，有很多相似的地方，甚至連噬菌體都可以互通（也就是說，感染沙門氏桿菌的噬菌體也可以感染大腸桿菌）。

雖然我們要感謝抗生素可以消滅無症狀帶原者，但是這些年來濫用抗生素的結果，對於抗生素有抗藥性的傷寒桿菌(MDR-typhoid)也相當多了。

在我寫這篇文章的時候，不知不覺已經早上11點15分了，不知道那位末日預言者現在在警局了嗎？

本文原發表於Miscellaneous999[2011-05-10]

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為什麼有些人吃不胖，有些人沒抽菸卻得肺癌，有些人只是吃個感冒藥就全身皮膚紅腫發癢？這一切都跟我們的基因有關！無論是想探究生命的起源、物種間的差異，乃至於罹患疾病、用藥的風險，都必須從了解基因密碼著手，而揭開基因密碼的關鍵工具就是「基因定序」技術。

基因定序對人類生命健康的意義

在歷史上，DNA 解碼從 1953 年的華生（James Watson）與克里克（Francis Crick）兩位科學家確立 DNA 的雙螺旋結構，闡述 DNA 是以 4 個鹼基（A、T、C、G）的配對方式來傳遞遺傳訊息，並逐步發展出許多新的研究工具；1990 年，美國政府推動人類基因體計畫，接著英國、日本、法國、德國、中國、印度等陸續加入，到了 2003 年，人體基因體密碼全數解碼完成，不僅是人類探索生命的重大里程碑，也成為推動醫學、生命科學領域大躍進的關鍵。原本這項計畫預計在 2005 年才能完成，卻因為基因定序技術的突飛猛進，使得科學家得以提前完成這項壯舉。

提到基因定序技術的發展，早期科學家只能測量 DNA 跟 RNA 的結構單位，但無法排序；直到 1977 年，科學家桑格（Frederick Sanger）發明了第一代的基因定序技術，以生物化學的方式，讓 DNA 形成不同長度的片段，以判讀測量物的基因序列，成為日後定序技術的基礎。為了因應更快速、資料量更大的基因定序需求，出現了次世代定序技術（NGS），將 DNA 打成碎片，並擴增碎片到可偵測的濃度，再透過電腦大量讀取資料並拼裝序列。不僅更快速，且成本更低，讓科學家得以在短時間內讀取數百萬個鹼基對，解碼許多物種的基因序列、追蹤病毒的變化行蹤，也能用於疾病的檢測、預防及個人化醫療等等。

在疾病檢測方面，儘管目前 NGS 並不能找出全部遺傳性疾病的原因，但對於改善個體健康仍有積極的意義，例如：若透過基因檢測，得知將來罹患糖尿病機率比別人高，就可以透過健康諮詢，改變飲食習慣、生活型態等，降低發病機率。又如癌症基因檢測，可分為遺傳性的癌症檢測及癌症組織檢測：前者可偵測是否有單一基因的變異，導致罹癌風險增加；後者則針對是否有藥物易感性的基因變異，做為臨床用藥的參考，也是目前精準醫療的重要應用項目之一。再者，基因檢測後續的生物資訊分析，包含基因序列的註解、變異位點的篩選及人工智慧評估變異點與疾病之間的關聯性等，對臨床醫療工作都有極大的助益。

建立屬於臺灣華人的基因庫

每個人的基因背景都不同，而不同族群之間更存在著基因差異，使得歐美國家基因庫的資料，幾乎不能直接應用於亞洲人身上，這也是我國自 2012 年發起「臺灣人體生物資料庫」（Taiwan biobank），希望建立臺灣人乃至亞洲人的基因資料庫的主因。而 2018 年起，中央研究院與全臺各大醫院共同發起的「臺灣精準醫療計畫」（TPMI），希望建立臺灣華人專屬的基因數據庫，促進臺灣民眾常見疾病的研究，並開發專屬華人的基因型鑑定晶片，促進我國精準醫療及生醫產業的發展。

目前招募了 20 萬名臺灣人，這些民眾在入組時沒有被診斷為癌症患者，超過 99％ 是來自中國不同省分的漢族移民人口，其中少數是臺灣原住民。這是東亞血統個體最大且可公開獲得的遺傳數據庫，其中，漢族的全部遺傳變異中，有 21.2％ 的人攜帶遺傳疾病的隱性基因；3.1％ 的人有癌症易感基因，比一般人罹癌風險更高；87.3％ 的人有藥物過敏的基因標誌。這些訊息對臨床診斷與治療都相當具實用性，例如：若患者具有某些藥物不良反應的特殊基因型，醫生在開藥時就能使用替代藥物，避免病人服藥後產生嚴重的不良反應。

基因時代大挑戰：個資保護與遺傳諮詢

雖然高科技與大數據分析的應用在生醫領域相當熱門，但有醫師對於研究結果能否運用在臨床上，存在著道德倫理的考量，例如：研究用途的資料是否能放在病歷中？個人資料是否受到法規保護？而且技術上各醫院之間的資料如何串流？這些都需要資通訊科技（ICT）產業的協助，而醫師本身相關知識的訓練也需與時俱進。對醫院端而言，建議患者做基因檢測是因為出現症狀，希望找到原因，但是如何解釋以及病歷上如何註解，則是另一項重要議題。

從人性觀點來看，在技術更迭演進的同時，對於受測者及其家人的心理支持及社會資源是否相應產生？回到了解病因的初衷，在知道自己體內可能有遺傳疾病的基因變異時，家庭成員之間的情感衝擊如何解決、是否有對應的治療方式等，都是值得深思的議題，也是目前遺傳諮詢門診中會詳細解說的部分。科技的初衷是為了讓人類的生活變得更好，因此，基因檢測如何搭配專業的遺傳諮詢系統，以及法規如何在科學發展與個資保護之間取得平衡，將是下一個基因時代的挑戰。

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