B 型肝炎是台灣很熟悉的傳染病，主要藉由血液、體液的交流傳染。它的歷史非常久遠，在世界各地普遍存在。新發表的論文報告：超過一萬年的人類遺骸中，已經能見到 B 型肝炎病毒（Hepatitis B virus，簡稱 HBV）；各款遺傳品系萬年來起了又落，可謂各領風騷數千年。
古代 DNA 的研究，技術已經進步到可以由遺骸或環境樣本，定序裡頭所有的 DNA 片段。例如取自人類牙齒的樣本，定序不只能獲得人類的 DNA，也可能捕獲當事人生前口腔中的微生物。所以同一份樣本被定序後，可以進行不同目的之探索。
論文的 B 型肝炎病毒取樣地點、年代。A 為歐亞大陸的古代樣本，B 為美洲的古代樣本，C 為現代各地流行的基因型分布狀況。圖／參考資料 1 和人類一起移民美洲，獨立發展的 B 肝病毒 B 肝病毒以 DNA 為遺傳物質，被感染的人去世後，病毒的 DNA 可能保留在死人骨頭、牙齒中，因此有機會被偵測到。新問世的論文搜尋資料庫，在世界各地 137 個古代樣本中，偵測到 B 肝病毒的存在。
這批古代 B 肝病毒，年代介於距今 400 到 10500 年前，絕大部份位於歐亞大陸西部和美洲。將各款病毒擺在一起畫演化樹，美洲的古代病毒自成一群，和歐亞大陸的同類平行發展。
一直到數百年前歐洲人殖民以前，美洲的 B 肝病毒都自成一群，最古老的樣本距今約 9000 年，位於安地斯高地的 Cuncaicha 岩蔭遺址（CUN002）。
如今的 B 肝病毒被分為 10 種基因型，稱為 A 到 J 型。美洲流行的 H 型、F 型（genotype H、genotype F），便是這群病毒流傳至今的後裔。
現代、古代的 B 型肝炎病毒擺在一塊，畫出的演化樹。這兒估計的分家年代，相對比較晚。圖／參考資料 1 B 肝病毒的主要宿主是人類，大部分傳播會跟著人走。（北極區以外）美洲原住民的祖先從亞洲移民到美洲後，長期獨立發展，和其他地區缺乏交流。而美洲居民的 B 肝病毒也獨立演化超過一萬年，和人類遷徙、分家的狀況一致。
B 肝病毒在哪兒起源，有多資深？ 美洲和歐亞大陸的 B 肝病毒，在什麼時候分家？論文對此不敢給出肯定的答案，也許是一萬多年前，也可能較接近兩萬年前。不過再怎麼說，都比智人祖先離開非洲的年代，要更晚許久。
過去有學者認為，B 肝病毒的歷史能追溯到數萬年前，智人離開非洲的時候。一大證據來自澳洲原住民感染的 C4 亞型（subgenotype C4），和同類分家 5 萬年之久。
但是這回估計 C4 資歷應該不超過 4500 年，遠遠比人類移民抵達澳洲的年代更遲。由此推論，C4 很可能是後來才抵達澳洲的。
根據現有資訊推敲，B 肝病毒的共同祖先頂多處於 2 萬年前。但是更早以前是否已經存在，卻在歷史洪流中失傳呢？目前無法判斷，需要更多樣本才能釐清。
傳染病同類的不同品系間競爭激烈，若是新秀徹底取代老將並不意外。B 肝病毒在歐洲一萬年來的發展史，便是鮮明的興替實例。
歐亞大陸西部不同年代，B 肝病毒的品系存在感，以及其演化關係。圖／參考資料 1 歐亞大陸西部，延續四千年的上古霸權 137 個樣本，大部分位於歐亞大陸西部，可以看出比較詳細的端倪。簡單說：江山代有病毒出，各領風騷數千年。
距今 9000 到 11000 年前，歐洲一帶有 2 款遺傳品系；隨後的 7500 到 9000 年前，其中一款完全消失（Mesolithic 1，下圖左紅色），只剩另外一款（Mesolithic 2，下圖紫色），最早出現在高加索北部，接著在歐洲各處，缺乏農業，不定居的採集狩獵族群中廣傳。
距今 7500 到 11000 年前之間，歐亞大陸西部的 B 肝病毒型號分佈。圖／參考資料 1 接下來四千年，也就是距今 3500 到 7500 年前，歐洲和中東幾乎完全被另一群病毒佔領（WENBA，下圖綠色）。論文推測此一品系，是在距今 8000 年過後的歐洲新石器時代，隨著中東農夫移民潮進入歐洲，廣傳各地。
歐洲最初的農夫移民源於安那托利亞（現在屬於土耳其），可是約一萬年前，唯一的安那托利亞樣本卻不屬於這款（上圖左淡紅色），不是 WENBA 品系的直系祖先。
可想而知，目前取樣很有限之下，無法精準判斷各品系起源的位置與年代。每個時期可能都有多款品系共存，我們只能見到，當時存在感比較高的少數代表。
距今 3000 到 7500 年前之間，歐亞大陸西部的 B 肝病毒型號分佈。圖／參考資料 1 距今約 5000 年前，青銅時代開始之際，歐洲又有大量移民湧入，能追溯到其東方的草原地區。但是人類族群的 DNA 組成明顯改變之際，B 肝病毒卻沒有變化。或許這時歐洲、草原流行的品系是同一款，你傳我，我傳你，還是看不出差別？
反正歐亞大陸西部在這四千年間，各地的人們不管生活方式、文化差異多大，大家都共享同一款 B 肝病毒！
B肝病毒的興替：霸權崩潰與轉移 盛極四千年的 WENBA 戰隊，距今 3300 年前過後卻幾乎消失。取而代之的是至今仍然存在的 A 型品系（Genotype A，上圖右紅色、下圖左紅色），已知樣本中距今 3500 到 5000 年前分佈於中東、高加索、歐洲東緣；隨後又前進歐洲，到 1500 年前還很有存在感。
接下來興起的是 D 型品系（Genotype D，下圖藍色），與 A 型共存一段時間後，從 1500 年前起成為歐亞大陸西部的新興霸權，從此一直延續到現代。
現代到距今 3000 年前之間，歐亞大陸西部的 B 肝病毒型號分佈。圖／參考資料 1 江山代有 B 肝出，WENBA 戰隊為什麼會徹底退出江湖呢？論文推測，多半和距今 3000 多年前的氣候、政治等劇變有關。
青銅時代晚期，地中海東部、中東一帶發生大規模的崩潰潮 ，周圍的歐洲、埃及動蕩不安（知名的特洛伊戰爭就發生在那個時期），數個重要的政權、勢力瓦解，社會秩序崩解。希臘的邁錫尼文明，黎凡特地區的烏加里特等城邦，安那托利亞的西臺帝國都不復存在。
在人類的經濟、政治強權崩潰，人群大洗牌的同時，B 肝病毒似乎也跟著霸權轉移。
青銅時代晚期的動盪局勢。圖／取自 wiki 上古霸權仍有後裔！卻是半殘的？ 然而，在古代樣本沒有取樣到的地方，WENBA 戰隊仍有後裔持續傳承，衍生出 G 型品系（Genotype G）。如今它的存在感薄弱，遺傳多樣性很低，三千餘年來應該是悄悄地活著。
奇妙的是，G 型其實不算是健全的病毒，由於突變之故，它的核心蛋白（core protein）功能受到影響，而且無法生產「B 型肝炎 E 抗原（HBeAg）」，嚴重降低它的複製和感染能力。
曾經縱橫四千年的霸權，現存唯一後裔竟然是半殘的。但是 G 型也有其厲害之處：善於和其他病毒共生。現代的 G 型感染者，多數也同時是愛滋病患。而且 G 型品系的搭便車能力，很可能不是最近出現。
進一步考察非常驚人地發現，與其類似的突變缺失，其實古代樣本中相當常見：距今 3500 到 7000 年前，總共有 14 款略有差異的 B 肝病毒具有這些缺陷。
已知歐亞大陸西部的 83 位古代 B 肝宿主中，高達 22 人同時感染有缺失的病毒，以及健全的另一款品系（包括目前主流之一的 A 型）。半殘的 G 型品系似乎就靠著搭便車，一路前進到現在。
B 肝病毒的蛋白質組成。HBeAg 是關鍵成分，但是 G 型品系無法生產。圖／取自 wiki B型肝炎的歷史，也是全人類的歷史 感染 B 肝病毒多半不會致命，長期帶原卻會影響健康，有時候後果非常嚴重，因此被列為公衛計畫的打擊目標。台灣成功根除 B 肝病毒，是偉大的公衛成就，每一位居民都因此受益。
上萬年來普遍與人共生的 B 肝病毒，其歷史也是人類的一部分歷史。至今古代 B 肝病毒的研究，取樣幾乎都來自美洲和歐亞大陸西部，其餘地區如東亞、東南亞、非洲的樣本極少。B 肝病毒在這些地方如何演化，也令人好奇。
延伸閱讀 參考資料 Kocher, A., Papac, L., Barquera, R., Key, F. M., Spyrou, M. A., Hübler, R., … & Moiseyev, V. (2021). Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science, 374(6564), 182-188. Study traces the evolution of the hepatitis B virus from prehistory to the present 本文亦刊載於作者部落格《盲眼的尼安德塔石匠》 暨其 facebook 同名專頁 。
