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演進中的科學研究方法(4/4) – 運用巨量資料評價實驗結果的再現性

活躍星系核_96
・2014/08/08 ・4131字 ・閱讀時間約 8 分鐘 ・SR值 537 ・八年級

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Credit:Paul Mison CC BY-NC-SA 2.0
Credit: Paul Mison CC BY-NC-SA 2.0

文/ 陳紹慶(慈濟大學人類發展學系專任助理教授)

前三篇文章討論難以透過統計分析顯現的實驗效應,有可能是統計分析方法的限制,或者實驗方法還不能穩定再現實驗效應,或者實驗效應本來就很微弱。如果某種實驗效應有明確的理論意義,實際發生的案例故事告訴我們,曾經面對如此困境的研究者,會冒著竄改或假造資料數據的風險,爭取發表的機會,或者坦然面對同儕審查的考驗,投稿數十寒暑皆無法發表的「暗無天日」歲月。無論是那種狀況,對於科學知識的前進,或是科學研究者的生涯進程都是一種損耗。到底有沒有讓微弱但有意義的實驗效應,又能兼顧研究品質與誠信的研究及發表程序?使認真做實驗的研究者可以不走險路,發表再現性經得起同儕考驗的研究呢?

最後這一篇介紹二種有研究者或組織正在嘗試的方式,認識這些方式能理解考自已正在接受的科學新知是在什麼樣的狀況所產生的。因為我自已是從事行為科學領域的研究與教學,介紹的內容侷限於這領域的方法,如果讀者在其它科學領域涉獵已有一定程度,可做個比較,看看能不能從其中獲得啟發。

一、先登錄再現研究(Registered Replication Research)

我曾經在〈可重覆的實驗結果是科學進步的基礎?〉這篇文章介紹兩位心理學者,Rolf ZwaanDaniel Simons,發起並參與先登錄再現研究(Registered Replication Research)的過程所產生的討論,這次一起合作重現Hart與Albarracin於2011年發表在Pscyhological Science的原創性研究。這份研究設計兩篇內容相同的犯罪情節報導,一篇描述嫌疑犯意圖行為的動詞以未完成時貌描寫(imperfect aspect,例如 was doing),另一篇的動詞以完成時貌描寫(perfect aspect,例如did)。參與者隨機閱讀其中一篇報導,接著進行缺字母填空作業(例如將S _ _ P,中間缺少的兩個字母補起來),評估報導中主角的行為動機,或評估報導中犯人與受害者之間的意圖理解。三種評估都顯示閱讀用未完成時貌描寫的報導,參與者的表現分數都高於閱讀另一種報導的參與者,Hart與Albarracin稱此為未完成時貌效應(effect of imperfect aspect)。Zwann與Simons參與的這個專案,就是在不同實驗室以相同的程序及材料,測試此效應的再現性。

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寫這篇文章的時候這個專案還在進行中,我的介紹重點放在串連合作研究者的平台:open science framework (以下簡稱OSF),以及參與專案的研究與專業期刊的合作模式。OSF是一家非營利組織,成立於2011年,辦公室位於美國維吉尼亞州Charlottesville,採用github的運作架構,提供註冊的研究者組織合作研究的平台。現在已有結案的研究專案發表正式論文,例如之前我曾介紹的Many Lab Project(Klein et al., 2014)。Zwann與Simons都有參與的這個專案更是採用APS公布的預先登錄研究規劃協議(Pre-registered Protocol,專案成立之初就登錄於psychological science,投稿程序也同時開始,所有共同合作者都是未來通過psychological science的審查程序後,論文的共同作者。

不僅是研究完成後的原始數據,研究準備到執行的過程一切公開透明,不僅可維持研究誠信,因為投稿程序也同時展開,也可以加速實驗完成之後的審查時程。但是這種模式有研究題材的侷限性,最明顯的是專案題目一定要有明確預測結果的假設及實驗效應,因此再現已發表但多數研究者依然質疑的研究是最可能成案的題目,如果研究結果會牽涉科學發現產生的公益之外的利益,例如這篇blog提到的藥物開發研究,能否成案的因素有非科學的商業或政治因素考量。

為了達到參與專案的合作研究者都能在最接近的研究條件進行實驗,像是相同型號的電腦設備,個別差異條件接近的參與者,執行實驗的成本必定不能太高。因為每位合作者擁有的資源條件都不相同,需要高檔配備的神經電位紀錄或腦部活動造影研究,很難達成跨實驗室的共同再現。所以至目前為止經過OSF平台「揪團」的專案,多數是透過網路施測,或在個人電腦進行實驗的研究。而且除非主題有普世性,並非所有有意願的研究者都能合作。當重現Hart與Albarracin的專題開放徵求合作者時,我曾致信詢問專案發起人能否將實驗材料轉換為中文,找母語為中文的人士參與實驗,探討有無動詞時貌效應。果不其然得到無法合作的回覆,不過專案發起人肯定在不同語言文化背景中,探討有沒有存在類似效應的想法,也許中文地區的心理學者可以合作進行一個新的題目。

二、巨量研究(Mega Study)

實驗心理學的巨量研究是一種實驗讓有能力的人類產生反應的所有刺激,分批呈現給參與者,紀錄而得的資料庫,可以說是數個小實驗組合而成的超大型實驗。這種研究方式的概念可以追溯到實驗心理學的祖師爺Wilhelm Wundt,上個世紀末研究字詞閱讀的語言心理學家們開始使用這種方法突破不同小型實驗結果不一致的限制,方法就是請參與實驗的人員,對學過所有的母語詞彙(英語),進行真假詞判斷(Lexicon decision)與朗讀(reading aloud),參與者對每一條字詞的反應時間與錯誤反應,都用規劃好的紀錄方式儲存為資料庫。

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在此介紹兩種語言心理學的巨量研究實例。第一種是由單一實驗團隊完成的英文詞彙專案(English Lexicon Project),這是由華盛頓大學聖路易校區的David Balota教授領導的團隊收集815位的參與者對40,481個英文真詞與40,481個英文假詞進行的反應,讓有興趣應用的研究者能檢索這些資料,或者運用有理論意義的拼寫或拼音規則,從資料庫選擇可做小型實驗的詞彙。所以這個專案絕對沒有把所有心理學者的實驗都做盡,反而產生新的實驗操作指標,例如orthographic Levenshtein distance 20 (OLD 20,Yarkoni, Balota, and Yap, 2008)。

這個指標的定義非專業人士要理解會有些困難,但指標帶來的後續研究對科學新知有興趣的人者會想了解。OLD 20是評價英文詞彙之間外形相似度的量尺,如果用中文字類比,OLD 20可以告訴我們「王」與「玉」的外形相似度,和「王」與「主」的外形相似度是不同的,而且可以用數字表達相似的程度。這個指標比只用筆劃或字母的差異的相似度基準,提供更明確的計量尺度,之後引用這個指標的著名研究是法國Grainger教授領導的團隊,進行的狒狒識字實驗(Grainger, Dufau, Montant, Ziegler, and Fagot,  2012),泛科學的編輯也曾做過中文報導,只是不論中英文報導都沒有寫到Grainger教授是用OLD 20挑選給狒狒的實驗材料,以及做為分析狒狒識字反應的指標。如果因為我的解說,能促成研究中文的心理學家挑戰台灣彌猴的識字能力研究,也是不錯的貢獻。

另一種實例是跨實驗室團隊的合作成果,類似先登錄再現研究的模式,但是參與合作者不只關切一種或數種實驗的再現,而是所有能產生反應的刺激,以及長期以來相關的實驗研究因為程序的設定而有不一致的發現,例如呈現刺激的時間控制。語義促發(Semantic priming ,Hutchison et al., 2013)和遮蔽促發(Masked priming,Adelman et al., 2014)是這類代表,兩者都是讓要反應的刺激項目跟在呈現促發項目(probe 或 prime word)之後呈現,測量促發項目與刺激項目有關(例如「護士-醫生」,「蝴蝶-蜜蜂」)與兩者無關產生的反應差異。語義促發的項目之間時間差距較長(至少200毫秒),關聯性的操作以字詞語義為主;遮蔽促發的項目之間時間差距極短(約50毫秒左右),關聯性的操作以字詞外形相似度為主。兩種實驗分別用於探討晚期語義處理與早期知覺歷程,有心理學者提出整合兩者的理論,但直到今天還是以專注於一種歷程的理論與實驗方法的研究最有成果,也累積不少爭議。舉遮蔽促發的一項爭議,有英文字詞辨識是一個字母接著一個字母處理的理論,還是整體一起處理的理論。兩種理論的壁壘分明,傳統同儕審查很可能會使其中一方過度挑另一方的毛病,造成「不見天日」的問題。

Adelman等人合作的遮蔽促發巨量研究就有突破「不見天日」的目的,不僅納入已被兩方廣泛接受的實驗效應,也同時測量有爭議的實驗效應。這種模式可稱為「母雞帶小雞」,不是指學術界大咖帶領小咖,而是再現程度高的穩定實驗效應,與再現程度低但有理論意義的實驗效應放在一起測量。同時也能嘗試小型實驗少用的分析方法,例如這份遮蔽促發的巨量研究是供參與的各實驗室設備與參與者個別差異參數,各式已知的字詞外形相似度指標(如OLD 20),與各種實驗效應的相關性分析,讓其它研究者能探討有爭議的實驗效應為何微弱的原因。

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三、新世代的學習思維

實驗結果的可再現性是所有科學知識能被人類記載與傳達的基礎,行為科學的複雜度讓多數理論不易獲得有穩定再現的實驗證據支持,因此有先登錄再現研究與巨量研究的出現,補充小型實驗無法呈現所有可能性的侷限,這系列的前三篇說明這些侷限與研究者設定可驗證假設的否證哲學有關。小型實驗依然是研究者最能掌握的知識工具,這篇文章介紹的例子都顯示先登錄再現研究與巨量研究是開拓新題材的作業模式,大量資料為微弱實驗效應的再現性提供充份的評估,讓需要驗證或不易發表的小型研究有獲得肯定的機會。

傳統學習實驗的設計與分析的方針是再現經典小型實驗效應,著重實驗操作細節的安排與分析方法的演練, 不過缺乏對實驗主題演進的體認。我認為這樣的體認才能刺激學習者產生對知識現狀的了解,並提出新的問題與解決方法。先登錄再現研究不只完整公開研究過程,也強調有意願合作者必須理解參與過程的責任,如果能將這種模式落實於學習或訓練,不但能培養後進研究者鑑賞研究題目的眼光,以及執行研究過程應遵守的誠篤原則。我寫這四篇文章的期許是未來能培養有此見識的科學研究者,這樣的科學家才有能力將自已專攻的知識領域,真正落實在自已身處的社會環境之中。

參考文獻

  1. Adelman, J., Johnson, R., McCormick, S., McKague, M., Kinoshita, S., Bowers, J., . . . Davis, C. (2014). A behavioral database for masked form priming. Behavior Research Methods, 1-16. doi: 10.3758/s13428-013-0442-y
  2. Balota, D. A., Yap, M. J., Hutchison, K. A., Cortese, M. J., Kessler, B., Loftis, B., … Treiman, R. (2007, 12). The English Lexicon Project. Behavior Research Methods,39(3), 445-459. doi: 10.3758/BF03193014
  3. Grainger, J., Dufau, S., Montant, M., Ziegler, J. C., & Fagot, J. (2012, 12). Orthographic Processing in Baboons (Papio papio). Science,336(6078), 245-248. doi: 10.1126/science.1218152
  4. Hart, W., & Albarracin, D. (2011, 12). Learning About What Others Were Doing: Verb Aspect and Attributions of Mundane and Criminal Intent for Past Actions. Psychological Science,22(2), 261-266. doi: 10.1177/0956797610395393
  5. Hutchison, K. A., Balota, D. A., Neely, J. H., Cortese, M. J., Cohen-Shikora, E. R., Tse, C., … Buchanan, E. (2013, 12). The semantic priming project. Behavior Research Methods,45(4), 1099-1114. doi: 10.3758/s13428-012-0304-z
  6. Klein, R. A., Ratliff, K. A., Vianello, M., Adams Jr, R. B., Bahník, Š., Bernstein, M. J., . . . Nosek, B. A. (2014). Investigating Variation in Replicability. Social Psychology, 45(3), 142-152. doi: 10.1027/1864-9335/a000178
  7. Yarkoni, T., Balota, D., & Yap, M. (2008, 12). Moving beyond Coltheart’s N: A new measure of orthographic similarity. Psychonomic Bulletin & Review,15(5), 971-979. doi: 10.3758/PBR.15.5.971

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為什麼越累越難睡?當大腦想下班,「腸道」卻還在加班!
鳥苷三磷酸 (PanSci Promo)_96
・2026/04/30 ・2519字 ・閱讀時間約 5 分鐘

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本文與  益福生醫 合作,泛科學企劃執行

昨晚,你又在床上翻來覆去、無法入眠了嗎?這或許是現代社會最普遍的深夜共鳴。儘管換了昂貴的乳膠枕、拉上百分之百遮光的窗簾,甚至在腦海中數了幾百隻羊,大腦的那個「睡眠開關」卻彷彿生鏽般卡住。這種渴望休息卻睡不著的過程,讓失眠成了一場耗損身心的極限馬拉松 。

皮質醇:你體內那位「永不熄滅」的深夜警報器

要理解失眠,我們得先認識身體的一套精密防衛系統:下視丘-垂體-腎上腺軸(HPA axis) 。這套系統原本是演化給我們的禮物,讓我們在面對劍齒虎或突如其來的危險時,能迅速進入「戰鬥或快逃」的備戰狀態。當這套系統啟動,腎上腺就會分泌皮質醇 (壓力荷爾蒙),這種荷爾蒙能調動能量、提高警覺性,讓我們在危機中保持清醒 。

然而,現代人的「劍齒虎」不再是野獸,而是無止盡的專案進度、電子郵件與職場競爭。對於長期處於高壓或高強度工作環境的人們來說,身體的警報系統可能處於一種「切換不掉」的狀態。

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在理想的狀態下,人類的生理時鐘像是一場精確的接力賽。入夜後,身體會進入「修復模式」,此時壓力荷爾蒙「皮質醇」的濃度應該降至最低點,讓「睡眠荷爾蒙」褪黑激素(Melatonin)接棒主導。褪黑激素不僅負責傳遞「天黑了」的訊號,它還能抑制腦中負責維持清醒的食慾素(Orexin)神經元,幫助大腦順利關閉覺醒開關。

對於長期處於高壓或高強度工作環境的人們來說,身體的警報系統可能處於一種「切換不掉」的狀態 / 圖片來源:envato

然而,當壓力介入時,這場接力賽就會變成跑不完的馬拉松賽。研究指出,長期的高壓環境會導致 HPA 軸過度活化,使得夜間皮質醇異常分泌。這不僅會抑制褪黑激素的分泌,更會讓食慾素在深夜裡持續活化,強迫大腦維持在「高覺醒狀態(Hyperarousal)」。 這種令人崩潰的狀態就是,明明你已經累到不行,但大腦卻像停不下來的發電機!

長期的睡眠不足會導致體內促發炎細胞激素上升,而發炎反應又會進一步活化 HPA 軸,分泌更多皮質醇來試圖消炎,高濃度的皮質醇會進一步干擾深層睡眠與快速動眼期(REM),導致睡眠品質變得低弱又破碎,最終形成「壓力-發炎-失眠」的惡行循環。也就是說,你不是在跟睡眠上的意志力作對,而是在跟失控的生理長期鬥爭。

從腸道重啟好眠開關:PS150 菌株如何調校你的生理時鐘

面對這種煞車失靈的失眠困局,科學家們將目光投向了人體內另一個繁榮的生態系:腸道。腸道與大腦之間存在著一條雙向通訊的高速公路,這就是「菌-腸-腦軸 (Microbiome-Gut-Brain Axis, MGBA)」,而某些特殊菌株不僅能幫助消化、排便,更能透過神經與內分泌途徑與大腦對話,直接參與調節我們的壓力調節與睡眠節律。這種菌株被科學家稱為「精神益生菌」(Psychobiotics)。

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腸道與大腦之間存在著一條雙向通訊的高速公路,這就是「菌-腸-腦軸 (Microbiome-Gut-Brain Axis, MGBA)」/圖片來源:益福生醫

在眾多研究菌株中,發酵乳桿菌 Limosilactobacillus fermentum PS150 的表現格外引人注目。PS150菌株源於亞洲益生菌權威「蔡英傑教授」團隊的專業研發,累積多年功能性菌株研發經驗的科學成果。針對臨床常見的「初夜效應」(First Night Effect, FNE),也就是現代人因出差、換床或環境改變導致的入睡困難,俗稱認床。科學家在進行實驗時發現,補充 PS150 菌株能顯著恢復非快速動眼期(NREM)的睡眠長度,且入睡更快,起床後也更容易清醒。更重要的是,不同於常見的藥物助眠手段(如抗組織胺藥物 DIPH)容易造成快速動眼期(REM)剝奪或導致睡眠破碎化,PS150 菌株展現出一種更為「溫和且自然」的調節力,它能有效縮短入睡所需的時間,並恢復睡眠中代表深層修復的「Delta 波」能量。

科學家發現,即便將 PS150 菌株經過特殊的熱處理(Heat-treated),轉化為不具活性但保有關鍵成分的「後生元」(Postbiotics),其生物活性依然能與活菌媲美 。HT-PS150 技術解決了益生菌在儲存與攝取過程中容易失去活性的痛點,讓這些腸道通訊員能更穩定地發揮作用 。

在臨床實驗中,科學家觀察到一個耐人尋味的現象:當詢問受試者的主觀感受時,往往會遇到強大的「安慰劑效應」,無論是服用 HT-PS150 還是安慰劑的人,主觀上大多表示睡眠變好了。這種「體感上的進步」有時會掩蓋真相,讓人分不清是心理作用還是真實效益。

然而,客觀的生理數據(Biomarkers)卻揭開了關鍵的差異。在排除主觀偏誤後,實驗數據顯示 HT-PS150 組有更高比例的人(84.6%)出現了夜間褪黑激素分泌增加,且壓力荷爾蒙(皮質醇)顯著下降,這證明了菌株確實啟動了體內的睡眠調控系統,而不僅僅是心理安慰。

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最值得關注的是,對於那些失眠指數較高(ISI ≧ 8)的族群,這種「生理修復」與「主觀體感」終於達成了一致。這群人在補充 HT-PS150 後,不僅生理標記改善,連原本嚴重困擾的主觀睡眠效率、持續時間,以及焦慮感也出現了顯著的進步。

了解更多PS150助眠益生菌:https://lihi3.me/KQ4zi

重新定義深層睡眠:構建全方位的深夜修復計畫

睡眠從來就不只是單純的休息,而是一場生理功能的全面重整。想要重獲高品質的睡眠,關鍵在於為自己建立一個全方位的修復生態系。

這套系統的基石,始於良好的生活習慣。從減少睡前數位螢幕的干擾、優化室內環境,到作息調整。當我們透過規律作息來穩定神經系統,並輔以現代科學對於 PS150 菌株的調節力發現,身體便能更順暢地啟動睡眠開關,回歸自然的運作節律。

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與其將失眠視為意志力的抗爭,不如將其看作是生理機能與腸道微生態的深度溝通。透過生活作息的調整與科學實證的支持,每個人都能擁有掌控睡眠的主動權。現在就從優化生活型態開始,為自己按下那個久違的、如嬰兒般香甜的關機鍵吧。

與其將失眠視為意志力的抗爭,不如將其看作是生理機能與腸道微生態的深度溝通 / 圖片來源 : envato

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肺部為何會「結疤」?揭開比癌症更致命的「菜瓜布肺」,科學家如何找到破解惡性循環的新契機
鳥苷三磷酸 (PanSci Promo)_96
・2026/05/08 ・2041字 ・閱讀時間約 4 分鐘

本文由 肺纖維化(菜瓜布肺)社團衛教 合作,泛科學撰文

在現代醫學的警示清單裡,乳癌、大腸癌這些疾病大家都不陌生;但有一個「隱蔽且致命」的威脅卻常被忽視,那就是「肺纖維化」。其中最常見的類型「特發性肺纖維化」(IPF),其預後往往不太樂觀,確診後的五年存活率甚至比許多常見的癌症還低。

首先,我們得先破解一個迷思:肺纖維化並不是單一疾病,而是許多種間質性肺病的共同表現。當我們聽到「肺纖維化」,腦中常浮現「菜瓜布肺」的形象,患者的肺部外觀充滿一個個空洞與疤痕,像極了乾燥的絲瓜。這精準描繪了肺部組織逐漸硬化、失去彈性的過程。

更重要的是,IPF 這類肺纖維化的威脅在於「不可逆」的特性,一旦形成就很難逆轉。這跟部分 COVID-19 康復者身上、仍有機會復原的肺纖維化,是兩種完全不同的概念。

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IPF 這類肺纖維化的威脅在於「不可逆」的特性,一旦形成就很難逆轉 / 圖示來源:shutterstock

肺部為何會變成「菜瓜布」?

為什麼好端端的肺會變成菜瓜布?這其實是一場身體修復機制失控的結果。

「纖維化」的組織,就是肺部間質組織(interstitium)的疤痕化。間質是圍繞在肺泡周圍,包含血管與支持肺部結構的結締組織。在正常情況下,肺部損傷後會啟動修復機制,並再生健康組織。但在肺纖維化的患者體內,這套修復機制卻「當機」了。

身體會不斷地發出訊號,導致負責修復工作的「纖維母細胞」(fibroblasts)被過度活化,進而失控地沉積膠原蛋白疤痕組織,最終在肺部形成永久性的纖維化。

科學家發現,這個過程之所以棘手,在於它是一個「惡性循環」,肺部同時存在著「發炎反應」與「纖維化」這兩條路徑 ,它們相互加乘,演變成難以阻斷的強大破壞力。

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雖然特發性肺纖維化 (IPF) 的具體成因不明 ,但已知某些特定族群的風險更高。例如抽菸,特定年齡與性別(50歲以上男性)、長期暴露於粉塵環境的工作者(農業、畜牧業、採礦業…)、胃食道逆流者。此外,患有自體免疫疾病(如類風濕性關節炎、乾燥症、硬皮症、皮肌炎/多發性肌炎,)的患者,他們併發肺纖維化的機率遠高於一般人,必須特別警覺。

雖然特發性肺纖維化 (IPF) 的具體成因不明 ,但已知某些特定族群的風險更高。/ 圖示來源:shutterstock

打斷惡性循環的挑戰,為何只對抗「纖維化」還不夠?

面對這個不可逆的疾病,醫學界長年束手無策,直到 2014 年才迎來一道曙光。美國 FDA 批准了兩種機制不同的新藥:Nintedanib 和 Pirfenidone。這兩種藥物的出現是治療史上的分水嶺,首度被證實能夠「延緩」IPF 患者肺功能的惡化速度。

然而,這場戰役尚未結束。現有的治療雖然帶來了希望,卻也凸顯了「未被滿足的醫療需求」。從機制上來看,這些藥物主要抑制的是「纖維化路徑」。

這讓科學界開始思考這個未被滿足的棘手問題:既然疾病的本質是「發炎」與「纖維化」的雙重打擊,那麼,我們是否能找到「同時抑制」這兩條路徑的全新策略,從而更有效地打斷這個惡性循環?

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找到同時調控「發炎」與「纖維化」的新靶點

為了解決難題,科學家將目光鎖定在一個細胞內的酵素:磷酸二酯酶 4B(PDE4B)

為什麼鎖定它?讓我們看看它的「雙重作用」機制:

  1. 關鍵位置: PDE4B 同時存在於免疫細胞(與發炎有關)與纖維母細胞(與纖維化有關)當中。
  2. 作用機制: PDE4B 的主要工作是降解細胞內一種叫 cAMP(環磷酸腺苷) 的訊號分子。cAMP 可以被視為細胞內的「穩定信號」。
  3. 雙重抑制: 當我們使用藥物抑制了 PDE4B 的活性,細胞內的 cAMP 就不會被分解,濃度會隨之升高。高濃度的 cAMP 能穩定免疫細胞和纖維母細胞,同時產生抗發炎抗纖維化的雙重效應。

簡單來說,鎖定並抑制 PDE4B,就像是同時抑制了免疫風暴與纖維化的工程,有望從雙從抑制打擊這個惡性循環。

全球臨床試驗帶來的新希望

近十年來,全球在肺纖維化領域投入了大量的臨床試驗,我們相信,在科學家逐步破解肺纖維化惡性循環的複雜難題後,期盼未來能為無數患者爭取到更安全、健康的生活與未來。

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最後,我們必須再次提醒,特發性肺纖維化(IPF)與漸進性肺纖維化(PPF)是極具破壞性、且不可逆的疾病。面對這個比癌症更致命的對手,雖然現有的治療手段能延緩惡化,但無法逆轉已經形成的肺部疤痕組織,因此「早期診斷、早期治療」仍是對抗肺纖維化最重要的黃金時刻。

必須再次提醒,特發性肺纖維化(IPF)與漸進性肺纖維化(PPF)是極具破壞性、且不可逆的疾病。/ 圖示來源:


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傳說「吃鳳梨可對抗飛蚊症」,這個「研究結果」搞錯了些什麼?
Mr. S
・2019/05/30 ・4006字 ・閱讀時間約 8 分鐘 ・SR值 543 ・八年級

最近幾日,一篇有關吃鳳梨可以減緩或消滅飛蚊症的文章在各個社群媒體瘋傳,大概看了不下五則貼文,覺得實在不對勁,就看了一下原始論文。不看不知道,一看不得了,這實在不是一個嚴謹的研究,研究結果必須要打上一個大問號。如果這種似是而非的結論,加上媒體的渲染,可能會造成一些負面結果。至於有哪些懷疑的根據與擔心,就請看下去。

編按:相關的網路新聞如下,族繁不及備載

什麼是飛蚊症?

眼球中有很大部分充滿著無色透明的膠狀物質,稱作玻璃體(vitreous body),正常情況下的玻璃體是澄清的,可以讓光線通過,在視網膜上成象。如果今天因為一些原因,讓玻璃體中的液體不再澄清,有一些懸浮物,就會影響成象,就好像眼前出現一隻打不到的蚊子一樣。

飛蚊症的成因,主要有幾種:玻璃體混濁(有懸浮物)、周邊組織出血流入玻璃體、周邊視網膜破裂、玻璃體後脫離(posterior vitreous detachment,PVD)。

「吃鳳梨可對抗飛蚊症」文章來源

這一篇文章,標題是「Pharmacologic vitreolysis of vitreous floaters by 3-month pineapple supplement in Taiwan: a pilot study」,由輔英科技大學附設醫院眼科主治醫師洪啟庭、大仁科技大學藥學系陳福安、郭代璜、謝博銓教授、陳立材助理教授、中山醫學大學視光學系黃宣瑜教授,另外還有一位作者是政府官員:高雄市社會局長葉壽山;文章發表於 Journal of American Science。

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文章內容:固定吃鳳梨,減少飛蚊症?!

文章中找了共 388 位受試者,分成兩組,一組依照分成玻璃體內懸浮物多寡,再分成兩小組,每天固定吃兩塊 100 克的鳳梨;另一組再分成三小組,分別給予每天 120、240、360 克的鳳梨。兩組每個月各追蹤一次,總共追蹤三個月。最後發現到了第三個月,所有組別的懸浮物數量都有減少,好轉人數比例 54.5% 到 74.2% 不等;玻璃體懸浮物有所減少的人數,與開始吃鳳梨前,呈現顯著減少關係。在討論中,作者也舉了一些關於鳳梨酵素(bromelain,鳳梨蛋白酶)的研究,試圖解釋實驗結果與機轉,最後作者做出以下的宣稱:

  1. 鳳梨酵素可以為人類飛蚊症、PVD 與 玻璃體纖維化帶來新的研究觀點。
  2. 持續食用鳳梨有助於飛蚊症的改善。
  3. 這篇研究是全世界第一篇提出「每日補充鳳梨,可以作為目前飛蚊症常規醫療之外的便宜另類療法」的文章。
    (原文:Our studies revealed that the pineapple supplement every day can offer a cheap alternative to current therapies for the vitreous floaters which is the first report in the world.)

感覺好像期刊論文該有的格式與格局都有了,但是細細一看,其中大有疑竇。

「吃鳳梨可對抗飛蚊症」發表的文章乍看之下格式跟描述像有這麼回事,但其中值得懷疑的點很多。Photo via Good Free Photos

此研究值得懷疑的要點

1. 沒有交代受試者背景

一開始的介紹提到了,造成飛蚊症有許多的原因,其實就連玻璃體混濁,也有許多成因。文章中沒有提到這些飛蚊症患者的病因或背景,就連男女與年紀比例都沒有提到。

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2. 研究缺乏對照組

國小、國中就教過了,做實驗必須要有對照組,才可以知道應變變因和操縱變因之間的關係。簡單來說,如果飛蚊症病人在實驗期間照常生活,但不吃鳳梨三個月,他們的飛蚊症會不會也改善了?這篇文章沒辦法回答。

在醫學研究中,大家可能有聽過安慰劑(placebo),這就屬於一種對照組實驗會使用的方法。另外,如果一開始設計實驗時,就想探究鳳梨的某個特定成分(例如鳳梨酵素)會不會才是改善飛蚊症的主要因子,也可以加入測試,會讓說服力大於僅止在討論章節中進行文獻探討。

3. 統計方法的錯用

在這邊使用了變異數分析(analysis of variance, ANOVA),但以這份資料的型態,一般不會使用 ANOVA 分析。

4. 措辭誇張異常

從文章第一句「 This survey is the first one in world……」,到文章討論也可見「the first report in the world」,似乎作者興奮得想向全世界展示這份研究成果,文中也可見其他似乎不必要的溢美詞句;搭配結果讀來,似乎少了一些期刊的嚴謹性。
如果這篇真的是確確實實的世界 number 1,大可以投到頂尖期刊如《新英格蘭醫學雜誌》(NEJM, IF=79.258)、《刺胳針》(The Lancet, IF=53.254),或者眼科界的頂尖期刊《British Journal of Ophthalmology》(IF=3.384)啊!為何會投在一篇比較少人聽聞的期刊呢?

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5. 許多令人感到不可思議的錯誤

隨便看看,就可以發現不少錯字與格式不一致。

  • 文章一開頭的作者服務單位,中山醫學大學附設醫院被打成了「Chunmg Shan Medical Hospital」,多了一個 m。
  • 表格中的 1st 和 2rd,前者有上標,後者沒有,那到底是要不要上標?
  • 表格中的「3rd」竟然寫成「3th」,原本的 rd 還誤植到 2 那邊!這是國小高年級的英文課內容吧,這種錯誤太不應該。
  • 93 頁尾,Müller and his ci-workers also found……,應該是想寫 co-workers 吧!

文章內幾個謬誤與誇張宣稱部分的截圖與標註。圖/截自原文期刊

6. 期刊編審素質堪憂

看到那麼多的謬誤,除了作者要負一部份責任,期刊編輯也是。一篇被刊出的文章可以被找到那麼多荒謬的錯誤,編輯責無旁貸,也說明了這家期刊的編審素質堪憂。

再看看這期的文章列表頁面,發現這篇文章的標題同時是第 3 篇與第 10 篇,差別就是作者之一的葉壽山局長在第 10 篇被拿掉了;而第 2 和第 5 篇根本是完全一模一樣的文章。這家期刊的編輯還好嗎?把文章重複放在期刊中,是想要衝出版量嗎?

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話說回來,這到底是哪家期刊?

The Journal of American Science 這家期刊自 2005 年創立,到今年也活到了第 15 年。

再來很功利地看看所謂的期刊影響因子(impact factor, IF),這家期刊在 Journal Citation Reports 網站中,沒有找到任何影響因子數字,可能未達收錄標準,實在是和作者那個誇張的宣稱無法匹配。

在查詢過程中發現一件很有趣的事。關於這個期刊的資訊並不多,但另外查到一個名字很像的期刊《American Journal of Science》,成立於 1818 年,是地球科學界的老牌頂尖期刊了,2017 年的 IF 值高達 3.893。看到這邊,是不是要懷疑一下這個《The Journal of American Science》,有沒有可能屬於之前引起廣泛討論的「掠奪型期刊」(predatory journals)?

還真的是掠奪型期刊啊!

掠奪性期刊與出版社,常披著開放取用、出版的理念與經營模式到處邀稿,藉此收入論文處理費,獲取大量的金錢利益。這些期刊大多數重量不重質,缺乏完整的同儕審閱(peer-review)與編審流程,常常是繳了錢,文章就可以被刊登、出版。

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這些掠奪性期刊除了繳錢就可刊之外,名字常常取得跟頂尖期刊一樣,常讓投稿者混淆,最後只好付錢了事,根本就像上了詐騙集團的當一樣。

近年來學界越來越重視掠奪型期刊議題,也統整了一些掠奪性期刊的名冊,可以讓研究者在投稿前先行檢查,以免踩雷。這邊查找了許多人使用的兩個清單:HBI list for Predatory JournalsBeall’s List,發現這個期刊和出版商 Marsland Press 赫然版上有名。

搭啦!原來這個「全世界第一篇」的研究,可能是個詐騙呢!

媒體報導沒有說出來的問題

雖然被我們發現這篇文章可能是個詐騙,但偏偏許多媒體的標題十分吸引注意力,彷彿每天乖乖吃鳳梨就可以扭轉飛蚊症。從前面的幾個質疑,可以知道「每天食用鳳梨」與「改善飛蚊症」之間的因果關係尚不明確(連有沒有關聯都要打上問號),因此可能沒辦法期待每天吃鳳梨三個月之後,眼前打不到的蚊子會因此變少。

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鳳梨雖然含有豐富的維他命 C 與纖維,但也含有比較高的糖份,如果長期、大量食用,可能讓體重悄悄上升。

另外,鳳梨的升糖指數也高(65),而飛蚊症的患者有一大部分是年長者,可能同時有糖尿病,這時候就要非常小心地控制鳳梨的食用量;如果因為看到心無標題就開始大量吃鳳梨,對於血糖控制相當不利,這是看到報導後應該要擔心的。

鳳梨的糖份相對來說比較高,長期大量食用也不太好啊。圖/photo by Claudia caloclau@Pixabay

結語:正視飛蚊症,但別輕信新聞啊

總體而言,有個新聞讓大家正視飛蚊症,或許是件好事,但看到有些不合理的措辭,就要再三小心。

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就算沒有把原始文獻找來看,也應當諮詢醫師,綜合評估後,再考慮是否選擇其他輔助治療措施。

相關資料

期刊原始文獻連結(建議不要邊吃飯邊看,有可能氣到吃不下)

附上熱心網友補充的文章與報導:

 

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Mr. S
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是個喜歡到處看看、隨便想想,不務正業的小勾椎;希望能把知識的可愛美好之處與大家分享。有一方小小儲思盆,歡迎來看看。

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演進中的科學研究方法(4/4) – 運用巨量資料評價實驗結果的再現性
活躍星系核_96
・2014/08/08 ・4131字 ・閱讀時間約 8 分鐘 ・SR值 537 ・八年級

Credit:Paul Mison CC BY-NC-SA 2.0
Credit: Paul Mison CC BY-NC-SA 2.0

文/ 陳紹慶(慈濟大學人類發展學系專任助理教授)

前三篇文章討論難以透過統計分析顯現的實驗效應,有可能是統計分析方法的限制,或者實驗方法還不能穩定再現實驗效應,或者實驗效應本來就很微弱。如果某種實驗效應有明確的理論意義,實際發生的案例故事告訴我們,曾經面對如此困境的研究者,會冒著竄改或假造資料數據的風險,爭取發表的機會,或者坦然面對同儕審查的考驗,投稿數十寒暑皆無法發表的「暗無天日」歲月。無論是那種狀況,對於科學知識的前進,或是科學研究者的生涯進程都是一種損耗。到底有沒有讓微弱但有意義的實驗效應,又能兼顧研究品質與誠信的研究及發表程序?使認真做實驗的研究者可以不走險路,發表再現性經得起同儕考驗的研究呢?

最後這一篇介紹二種有研究者或組織正在嘗試的方式,認識這些方式能理解考自已正在接受的科學新知是在什麼樣的狀況所產生的。因為我自已是從事行為科學領域的研究與教學,介紹的內容侷限於這領域的方法,如果讀者在其它科學領域涉獵已有一定程度,可做個比較,看看能不能從其中獲得啟發。

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一、先登錄再現研究(Registered Replication Research)

我曾經在〈可重覆的實驗結果是科學進步的基礎?〉這篇文章介紹兩位心理學者,Rolf ZwaanDaniel Simons,發起並參與先登錄再現研究(Registered Replication Research)的過程所產生的討論,這次一起合作重現Hart與Albarracin於2011年發表在Pscyhological Science的原創性研究。這份研究設計兩篇內容相同的犯罪情節報導,一篇描述嫌疑犯意圖行為的動詞以未完成時貌描寫(imperfect aspect,例如 was doing),另一篇的動詞以完成時貌描寫(perfect aspect,例如did)。參與者隨機閱讀其中一篇報導,接著進行缺字母填空作業(例如將S _ _ P,中間缺少的兩個字母補起來),評估報導中主角的行為動機,或評估報導中犯人與受害者之間的意圖理解。三種評估都顯示閱讀用未完成時貌描寫的報導,參與者的表現分數都高於閱讀另一種報導的參與者,Hart與Albarracin稱此為未完成時貌效應(effect of imperfect aspect)。Zwann與Simons參與的這個專案,就是在不同實驗室以相同的程序及材料,測試此效應的再現性。

寫這篇文章的時候這個專案還在進行中,我的介紹重點放在串連合作研究者的平台:open science framework (以下簡稱OSF),以及參與專案的研究與專業期刊的合作模式。OSF是一家非營利組織,成立於2011年,辦公室位於美國維吉尼亞州Charlottesville,採用github的運作架構,提供註冊的研究者組織合作研究的平台。現在已有結案的研究專案發表正式論文,例如之前我曾介紹的Many Lab Project(Klein et al., 2014)。Zwann與Simons都有參與的這個專案更是採用APS公布的預先登錄研究規劃協議(Pre-registered Protocol,專案成立之初就登錄於psychological science,投稿程序也同時開始,所有共同合作者都是未來通過psychological science的審查程序後,論文的共同作者。

不僅是研究完成後的原始數據,研究準備到執行的過程一切公開透明,不僅可維持研究誠信,因為投稿程序也同時展開,也可以加速實驗完成之後的審查時程。但是這種模式有研究題材的侷限性,最明顯的是專案題目一定要有明確預測結果的假設及實驗效應,因此再現已發表但多數研究者依然質疑的研究是最可能成案的題目,如果研究結果會牽涉科學發現產生的公益之外的利益,例如這篇blog提到的藥物開發研究,能否成案的因素有非科學的商業或政治因素考量。

為了達到參與專案的合作研究者都能在最接近的研究條件進行實驗,像是相同型號的電腦設備,個別差異條件接近的參與者,執行實驗的成本必定不能太高。因為每位合作者擁有的資源條件都不相同,需要高檔配備的神經電位紀錄或腦部活動造影研究,很難達成跨實驗室的共同再現。所以至目前為止經過OSF平台「揪團」的專案,多數是透過網路施測,或在個人電腦進行實驗的研究。而且除非主題有普世性,並非所有有意願的研究者都能合作。當重現Hart與Albarracin的專題開放徵求合作者時,我曾致信詢問專案發起人能否將實驗材料轉換為中文,找母語為中文的人士參與實驗,探討有無動詞時貌效應。果不其然得到無法合作的回覆,不過專案發起人肯定在不同語言文化背景中,探討有沒有存在類似效應的想法,也許中文地區的心理學者可以合作進行一個新的題目。

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二、巨量研究(Mega Study)

實驗心理學的巨量研究是一種實驗讓有能力的人類產生反應的所有刺激,分批呈現給參與者,紀錄而得的資料庫,可以說是數個小實驗組合而成的超大型實驗。這種研究方式的概念可以追溯到實驗心理學的祖師爺Wilhelm Wundt,上個世紀末研究字詞閱讀的語言心理學家們開始使用這種方法突破不同小型實驗結果不一致的限制,方法就是請參與實驗的人員,對學過所有的母語詞彙(英語),進行真假詞判斷(Lexicon decision)與朗讀(reading aloud),參與者對每一條字詞的反應時間與錯誤反應,都用規劃好的紀錄方式儲存為資料庫。

在此介紹兩種語言心理學的巨量研究實例。第一種是由單一實驗團隊完成的英文詞彙專案(English Lexicon Project),這是由華盛頓大學聖路易校區的David Balota教授領導的團隊收集815位的參與者對40,481個英文真詞與40,481個英文假詞進行的反應,讓有興趣應用的研究者能檢索這些資料,或者運用有理論意義的拼寫或拼音規則,從資料庫選擇可做小型實驗的詞彙。所以這個專案絕對沒有把所有心理學者的實驗都做盡,反而產生新的實驗操作指標,例如orthographic Levenshtein distance 20 (OLD 20,Yarkoni, Balota, and Yap, 2008)。

這個指標的定義非專業人士要理解會有些困難,但指標帶來的後續研究對科學新知有興趣的人者會想了解。OLD 20是評價英文詞彙之間外形相似度的量尺,如果用中文字類比,OLD 20可以告訴我們「王」與「玉」的外形相似度,和「王」與「主」的外形相似度是不同的,而且可以用數字表達相似的程度。這個指標比只用筆劃或字母的差異的相似度基準,提供更明確的計量尺度,之後引用這個指標的著名研究是法國Grainger教授領導的團隊,進行的狒狒識字實驗(Grainger, Dufau, Montant, Ziegler, and Fagot,  2012),泛科學的編輯也曾做過中文報導,只是不論中英文報導都沒有寫到Grainger教授是用OLD 20挑選給狒狒的實驗材料,以及做為分析狒狒識字反應的指標。如果因為我的解說,能促成研究中文的心理學家挑戰台灣彌猴的識字能力研究,也是不錯的貢獻。

另一種實例是跨實驗室團隊的合作成果,類似先登錄再現研究的模式,但是參與合作者不只關切一種或數種實驗的再現,而是所有能產生反應的刺激,以及長期以來相關的實驗研究因為程序的設定而有不一致的發現,例如呈現刺激的時間控制。語義促發(Semantic priming ,Hutchison et al., 2013)和遮蔽促發(Masked priming,Adelman et al., 2014)是這類代表,兩者都是讓要反應的刺激項目跟在呈現促發項目(probe 或 prime word)之後呈現,測量促發項目與刺激項目有關(例如「護士-醫生」,「蝴蝶-蜜蜂」)與兩者無關產生的反應差異。語義促發的項目之間時間差距較長(至少200毫秒),關聯性的操作以字詞語義為主;遮蔽促發的項目之間時間差距極短(約50毫秒左右),關聯性的操作以字詞外形相似度為主。兩種實驗分別用於探討晚期語義處理與早期知覺歷程,有心理學者提出整合兩者的理論,但直到今天還是以專注於一種歷程的理論與實驗方法的研究最有成果,也累積不少爭議。舉遮蔽促發的一項爭議,有英文字詞辨識是一個字母接著一個字母處理的理論,還是整體一起處理的理論。兩種理論的壁壘分明,傳統同儕審查很可能會使其中一方過度挑另一方的毛病,造成「不見天日」的問題。

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Adelman等人合作的遮蔽促發巨量研究就有突破「不見天日」的目的,不僅納入已被兩方廣泛接受的實驗效應,也同時測量有爭議的實驗效應。這種模式可稱為「母雞帶小雞」,不是指學術界大咖帶領小咖,而是再現程度高的穩定實驗效應,與再現程度低但有理論意義的實驗效應放在一起測量。同時也能嘗試小型實驗少用的分析方法,例如這份遮蔽促發的巨量研究是供參與的各實驗室設備與參與者個別差異參數,各式已知的字詞外形相似度指標(如OLD 20),與各種實驗效應的相關性分析,讓其它研究者能探討有爭議的實驗效應為何微弱的原因。

三、新世代的學習思維

實驗結果的可再現性是所有科學知識能被人類記載與傳達的基礎,行為科學的複雜度讓多數理論不易獲得有穩定再現的實驗證據支持,因此有先登錄再現研究與巨量研究的出現,補充小型實驗無法呈現所有可能性的侷限,這系列的前三篇說明這些侷限與研究者設定可驗證假設的否證哲學有關。小型實驗依然是研究者最能掌握的知識工具,這篇文章介紹的例子都顯示先登錄再現研究與巨量研究是開拓新題材的作業模式,大量資料為微弱實驗效應的再現性提供充份的評估,讓需要驗證或不易發表的小型研究有獲得肯定的機會。

傳統學習實驗的設計與分析的方針是再現經典小型實驗效應,著重實驗操作細節的安排與分析方法的演練, 不過缺乏對實驗主題演進的體認。我認為這樣的體認才能刺激學習者產生對知識現狀的了解,並提出新的問題與解決方法。先登錄再現研究不只完整公開研究過程,也強調有意願合作者必須理解參與過程的責任,如果能將這種模式落實於學習或訓練,不但能培養後進研究者鑑賞研究題目的眼光,以及執行研究過程應遵守的誠篤原則。我寫這四篇文章的期許是未來能培養有此見識的科學研究者,這樣的科學家才有能力將自已專攻的知識領域,真正落實在自已身處的社會環境之中。

參考文獻

  1. Adelman, J., Johnson, R., McCormick, S., McKague, M., Kinoshita, S., Bowers, J., . . . Davis, C. (2014). A behavioral database for masked form priming. Behavior Research Methods, 1-16. doi: 10.3758/s13428-013-0442-y
  2. Balota, D. A., Yap, M. J., Hutchison, K. A., Cortese, M. J., Kessler, B., Loftis, B., … Treiman, R. (2007, 12). The English Lexicon Project. Behavior Research Methods,39(3), 445-459. doi: 10.3758/BF03193014
  3. Grainger, J., Dufau, S., Montant, M., Ziegler, J. C., & Fagot, J. (2012, 12). Orthographic Processing in Baboons (Papio papio). Science,336(6078), 245-248. doi: 10.1126/science.1218152
  4. Hart, W., & Albarracin, D. (2011, 12). Learning About What Others Were Doing: Verb Aspect and Attributions of Mundane and Criminal Intent for Past Actions. Psychological Science,22(2), 261-266. doi: 10.1177/0956797610395393
  5. Hutchison, K. A., Balota, D. A., Neely, J. H., Cortese, M. J., Cohen-Shikora, E. R., Tse, C., … Buchanan, E. (2013, 12). The semantic priming project. Behavior Research Methods,45(4), 1099-1114. doi: 10.3758/s13428-012-0304-z
  6. Klein, R. A., Ratliff, K. A., Vianello, M., Adams Jr, R. B., Bahník, Š., Bernstein, M. J., . . . Nosek, B. A. (2014). Investigating Variation in Replicability. Social Psychology, 45(3), 142-152. doi: 10.1027/1864-9335/a000178
  7. Yarkoni, T., Balota, D., & Yap, M. (2008, 12). Moving beyond Coltheart’s N: A new measure of orthographic similarity. Psychonomic Bulletin & Review,15(5), 971-979. doi: 10.3758/PBR.15.5.971

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