文 / 羅浩展
在北美,有些區域是山跟海的交界帶,而存在於這交界帶的土壤,除了要忍受平時冷到會結冰的氣溫之外,還要提防著乾燥溫暖的焚風(Foehn wind)。面對這樣溫度不定的環境,土壤中竟然有細菌存活了下來。到底這些細菌有著什麼樣的超能力去抵抗這樣惡劣的環境呢? 它們用了什麼樣的方法使它們得以存活下來呢? 接下來,就讓這篇論文帶你一探究竟。
在此篇論文裡,利用了循環性的瞬間結凍和解凍,瞬間模擬了這樣溫度不定的環境。將土壤拿來放在這樣條件底下進行處理後發現,竟有細菌存活下來。將這些細菌拿去進行16S 核糖體 RNA定序分析,序列放大出來發現有五種不同的菌屬。其中有一種是Chryseobacterium sp.strain C14,它們會合成一種特殊的抗凍蛋白 ,這種蛋白質可以鎮壓冰結晶的溫度,抑制冰的再結晶,還可以藉由修飾細胞膜上脂質來維持自己細胞膜的流動性,進而保護自己不受冰的凍傷。再來有一種菌類Pseudomonas,它們除了擁有抵禦冰的傷害的能力之外,還擁有了非常特別的能力。這個能力就是「抓冰」!
抓冰? 到底它們是如何抓冰的呢? 跟Chryseobacterium不一樣的是,Pseudomonas這類菌還會另外合成一種冰核蛋白(ice nucleation protein),而這些蛋白質會聚集在細胞膜之外,然後這些蛋白質就會以自己當作冰結晶的模板,來讓冰晶有吸附的停泊地而幫助冰晶的形成!
沒想到吧,細菌竟然能抓冰,想想看,如果能好好利用這些細菌抓冰的能力,說不定以後就不用慢慢地雕刻冰雕了。生物學家可以將這些細菌大量培養,然後將它們分佈到冰中的某些特定位置,理想狀況下這些細菌就會幫助冰雕模型的形成呢。更瘋狂的作法是,假如真得以培養超大量的抓冰細菌,對逐漸融化的冰山來說,就是一個福音。生物學家可以利用這些菌來抓住冰,或許就能延緩冰山的融化,讓大地的危機解除也說不定。
作者:羅浩展,生科系95級
名詞解釋:
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Foehn wind:北美地區的焚風。原因是當濕潤空氣受到山的阻擋而爬升,越爬升空氣越冷卻,造成水氣凝結降雨在迎風面。然後當其空氣越過山嶺後,因下降而形成乾燥空氣,而且因為下降時受到壓力壓縮而使溫度增加,就形成了熱而乾燥的焚風。
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AFPs(antifreeze proteins):這種蛋白質會破壞冰晶晶格的形成進而抑制冰的成長與再結晶。
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Ice nucleation protein:一種蛋白質可以當作冰晶結晶的吸附模板來促進冰的成長。
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16S ribosomal RNA gene定序:因為不同細菌帶有不同的16S ribosomal RNA gene,所以利用這種方式可分辨所獲得的細菌是哪一種菌。
研究原文
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Walker et al. 2006. Freeze-thaw tolerance and clues to the winter survival of a soil community. Applied and Environmental Microbiology 72: 1784-1792.
參考資料
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Wikipedia: Foehn wind.
- Wilson et al. 2006. Ice-active characteristics of soil bacteria selected by ice-affinity. Environmental Microbiology 8: 1816–1824.