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不只台灣,德國和祕魯恐將於2017年與Elsevier學術期刊分手

valerie hung
・2016/12/29 ・1605字 ・閱讀時間約 3 分鐘 ・SR值 532 ・七年級
  • 首圖來源:thomas claveirole@flickr, by CC2.0

總部位於荷蘭阿姆斯特丹的愛思唯爾(Elsevier),是世界上最大的學術期刊文獻出版社之一,旗下出版品超過 2500 本,包括知名學術期刊《刺胳針》(The Lancet)、《四面體》(tetrahedron)、《細胞》(Cell)等,佔全球學術期刊數量的四分之一。不過許多台灣、德國和秘魯的科學家,將迎來無法瀏覽 Elsevier 電子期刊資料庫的一年?

學術期刊出版巨人 Elsevier。
學術期刊出版巨人 Elsevier,旗下有超過 2500 本期刊。

面對國際學術期刊強硬的包套訂閱方案及逐年增長的費用,全球學術圈都叫苦連天。即使有大學嘗試以退訂、拒絕投稿和鼓勵研究成果採開放形式(open access)發表做抵抗,最後往往還是為了自家研究人員,選擇與出版社妥協。

但荷蘭學術圈決定採取更積極的行動。面對漲漲不休的年費,2015 年荷蘭政府出面協助談判,希望 2016 年開放四成荷蘭研究者的論文,可惜 Elsevier 不賞臉,隨後 14 所荷蘭公立研究大學組成的學術聯盟展開聯合杯葛,向 Elsevier 施壓。經過一番角力,最終以荷蘭學術聯盟再多付一點費用,而 Elsevier 同意到 2018 年開放三成荷蘭論文的階段性目標達成協議

學術界團結起來,抵制期刊付費高牆?

隨著荷蘭學術圈的反撲,2016 年年底,德國與台灣的學術圈也決定「硬起來」。

由德國國立大學、技職學校、研究機構與公立圖書館組成的 DEAL 聯盟,今年 12 月和 Elsevier 出版社討論 2017 年合約時遇到困難,他們希望所有德國科學家的論文都能開放,但 Elsevier 卻端出定價更高,且不含開放使用條款的方案,導致談判破裂。聯盟發言人希普勒(Horst Hippler)表示:「我們實在無法接受 Elsevier 目前的提案。」預計 2017 年 1 月重啟談判。

數百家德國大學不會立即「斷炊」,因為他們在 DEAL 成立前,多半有和  Elsevier 簽過自己的合約,但仍有 60 多間機構將受到衝擊,就看要不要和出版社單獨議價。

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圖/Mr impossible@wikipedia, by CC3.0

同時間在台灣,台灣大學圖書館 12 月 6 日發表聲明,因無法負擔固定漲幅 4%且不得刪訂期刊的方案,2017 年起停訂 Elsevier ScienceDirect 期刊。聲明中表示:

「該公司在期刊出版的壟斷現狀,以及不合理的訂價政策導致過於昂貴的訂費,早為全球各大學所詬病。」

台灣學術電子資訊資源共享聯盟(CONCERT)也在 12 月 7 日宣布,Elsevier 的 ScienceDirect 電子期刊全國購置費用逐年不斷攀升,2016年較 2008 年增加了 53%。經多次談判減價或削減期刊訂閱數無果,暫緩和 Elsevier 更新合約。許多大學校院圖書館與研究機構都表示支持 CONCERT 抵制 Elsevier 的行列(註:CONCERT 目前有 215 名會員,包含台灣眾多國、私立大學、科技大學、學院、專科與中研院等研究機構)

其實所處研究單位不續訂,研究人員還是有幾種合法管道可以瀏覽新出爐的論文。例如使用國際期刊文獻傳遞服務(Rapid ILL)、透過圖書館的館際合作調閱文獻、向原作者尋求論文原本、向作者所屬單位的機構典藏平台詢問,以及查詢網路資源如 Google Scholar。

除了德國和台灣的學術圈反彈,祕魯政府則是因為不明原因,砍掉秘魯科技委員會(CONCYTEC) 2017 年的 Elsevier Science Direct 及 Scopus 電子期刊訂閱補助金。

一位 30 歲的祕魯植物學家低調表示,未來會改透過非法網站如 Sci-Hub 下載論文,所以不太擔心,他身邊有 95% 的人都是這麼做的。但也有祕魯科學家不願意使用 Sci-Hub,認為這不是長遠之道,「希望政府了解資料庫的重要性」。(註:Sci-Hub 由哈薩克研究生艾爾巴金(Alexandra Elbakyan)在 2011 年創立,她攻讀碩士時因學校沒有期刊資源,改透過各種管道尋求研究文獻,這個經驗讓她開發 Sci-Hub 網站,收集付費期刊並供人免費下載,幫助各國貧窮的學生與科學家。想了解更多請參考報導者。)

 

參考資料:


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valerie hung
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興趣多多,書籍雜食者,喜歡問為什麼,偶爾也愛動手嘗試。


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臺灣半數肺癌患者沒吸菸!不吸菸肺癌的致病成因是?

PanSci_96
・2020/07/20 ・2263字 ・閱讀時間約 4 分鐘 ・SR值 605 ・十年級

肺癌傳統被認為與吸菸畫上等號,不過,臺灣的不吸菸肺癌患者卻比吸菸者多。中央研究院與臺大醫學院跨單位研究團隊以蛋白基因體技術建立臺灣早期肺癌病人的多體學大數據,找到不吸菸肺癌患者可能的致病機制。

研究主要有三個發現,首先是肺癌和人體體內APOBEC*突變特徵的高低、其次與致癌物的曝露有關;最後更發現一個從未被發現的新亞型肺癌,及其致癌基因突變的差異,有助早期發現臨床潛在的高風險肺癌患者。

*註:APOBEC的突變被認為跟癌症的發生有關。

研究主持人中研院化學所所長陳玉如表示,「這是東亞第一套結合深度多體學大數據及完整臨床資料,深度解析不吸菸肺癌成因的研究成果」,也是美國臨床蛋白基因體學腫瘤分析聯盟(CPTAC)首次和國際聯盟團隊(臺灣)攜手合作,以蛋白基因體學揭開臺灣及美國病人肺癌生物學的面紗。臺美二個獨立成果於今年(2020)7月9日同步發表在國際頂尖期刊《細胞》《Cell》上,並共同榮登本期雜誌封面。

肺癌致病的關鍵:APOBEC突變特徵、致癌物效應

肺癌是全球癌症死亡的主因,即使藥物治療近年有長足的進展,5年存活率仍低於20%,目前仍是國人癌症死亡頭號殺手。研究指出,在美國不吸菸者約佔肺癌患者的20%,而東亞地區(包括臺灣)的肺腺癌有獨特的特色,不吸菸者(尤其是女性)患病的比率高過於吸菸者。在臺灣有50%以上的肺癌病患並不吸菸,超過9成得肺癌的女性都不抽菸,而且近十年有年輕化的趨勢。為釐清東亞不吸菸肺癌的致病機制,此研究分析東亞地區103名肺癌病患,探究早期不吸菸肺癌的發病與進展。

癌細胞基因突變結果顯示,東西方病人突變的基因背景大為不同;肺腺癌癌變與APOBEC的突變特徵很有關。罹癌患者中,高達74%從未吸菸年輕女性(小於60歲)和所有無肺癌「表皮生長因子受體(EGFR)」 驅動突變的女性患者APOBEC突變特徵程度高,顯示APOBEC的突變特徵可能為女性早期肺癌的驅動因素;而高APOBEC突變特徵又與免疫療法療效呈正相關。因此,APOBEC突變特徵可能成為早期診斷和免疫治療的潛在生物標誌物。

此外,研究也發現,暴露於致癌物而引起的基因體編輯突變特徵,亦可能是癌症早期的主要驅動因素。在部分較年長女性(大於70歲)中程度較高,化學致癌物代謝和解毒過程及特定途徑的活化可能影響腫瘤癌化、惡化和免疫調節異常。換言之,減少生活中致癌物的暴露率可能是預防肺癌的有效策略。

發現「新亞型」肺癌 有助早期發現潛在高風險患者

過去研究已知,臺灣肺癌患者主要在EGFR基因上會發生Del19和L858R兩種突變,病患若是發生L858R突變,存活率較低,且容易產生惡性胸腔積液和癌細胞轉移,不過至今仍未發現明確的生物機轉。此次透過蛋白體學特徵可將肺腺癌分為五個亞型,其中有一個從未被發現的新型早期肺癌「類晚期」亞型。此亞型可區分出Del19和L858R突變的腫瘤在早期癌症之惡性特徵。因此,臨床醫師有機會可藉惡性特徵發現早期肺癌患者,進一步提供密集的監測和考慮可能的佐劑加以治療。此外,「類晚期」亞型的早期腫瘤也可發現顯著增加的蛋白,如間質溶解素MMP11等,可能可以作為檢測的生物標誌。

東亞第一個解析不抽菸肺腺癌之多體學大數據

工欲善其事,必先利其器,有賴於深度蛋白質基因體技術和多體學數據整合分析,及臺灣肺癌臨床團隊提供高品質檢體及臨床資料分析,此次跨領域及院校研究方能就東亞肺癌有此重大突破。肺癌團隊主持人楊泮池指出,「蛋白基因體學發現不吸菸肺癌患者在腫瘤發生和癌症進程上存在著人種和地域上的獨特性,此研究為早期不吸菸者肺腺癌提供了新的見解」。

除中研院之外,研究團隊成員由臺灣大學、臺北醫學大學、臺中榮總提供病人檢體、臨床數據及檢測技術等,共同呈現前所未有的東亞肺腺癌完整鳥瞰圖景,包括針對男女族群、吸菸與不吸菸族群,描繪出更清晰的肺腺癌疾病進程,並且發現新的癌症標誌物與找出導致臺灣肺腺癌的可能病因。

首次攜手合作 臺美「癌症登月計畫」重大發現

本院擁有領先世界的蛋白基因體技術、生物資訊分析平台與大數據分析技術,且臺灣醫療團隊具備完善的長期追蹤資料。藉此優勢,本院與美國國家癌症研究所(National Cancer Institute, NCI)於2016年簽署「癌症登月計畫(Cancer Moonshot)」合作備忘錄,參與國際癌症蛋白基因體學聯盟(International Cancer Proteogenome Consortium, ICPC)。同年10月臺灣通過生醫產業推動方案,科技會報將癌症登月計畫納入為「推動特色重點產業」策略之一,提供利用蛋白基因體大數據開發創新診斷及新藥研發之契機。

持續關注肺腫瘤生物學及早期肺腺癌的研究進展,將有助推動肺癌檢測開發和相關管理策略。「癌症登月計畫」臺灣團隊認為,臨床資訊、多體學技術及體學大數據為發展癌症精準醫學之必要基礎工程,為欲深入研究和發展肺腺癌精準醫療的研究人員和臨床醫生的最大後盾。若能進一步凝聚跨學研單位、醫學中心及跨部會及產學合作,透過與國際癌症登月計畫團隊分享各國數據與資源,持續研發新策略,有助未來發展臺灣特色的精準醫學。

記者會合影

論文共同第一作者為本院化學所陳誼如博士後研究員、本院統計所張雅媗博士後研究員及英國癌症研究所Theodoros I. Roumeliotis,本院資訊所陳鯨太博士後研究員及時任本院化學所林妙霞博士後研究員(現任臺灣大學)亦列為共同第二作者。研究團隊包括本院化學所陳玉如所長、臺大醫學院內科教授楊泮池(本院院士)、本院統計所陳璿宇副研究員、英國癌症研究所Jyoti S. Choudhary、臺灣大學醫學檢驗暨生物技術學系與基因體暨精準醫學研究中心俞松良教授、臺大醫院外科醫師陳晉興、本院資訊科學研究所宋定懿研究員及臺北醫學大學韓嘉莉助理教授等。本次研究經費主要來自科技部、中研院及臺灣大學支持。


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