同治元年（1862 年）春，已是中年的徐壽偕同小他十五歲的同鄉青年華蘅芳來到兩江總督曾國藩營中。他們兩人因一起研究西學、仿製西方器械而頗有盛名，因而以「才能之士，能通曉制造與格致之事者」的資格，受到曾國藩的保舉任用。面對曾國藩的讚揚與期許，徐壽感慨萬千。一方面，他為父母雙雙早逝，無緣親見他未經科舉考試卻仍能獲得朝廷重用而感到遺憾，另一方面，卻又感到心虛，因為他當初放棄傳統仕途，潛心研究西學，可不是有什麼深謀遠見或救國抱負，純粹是因為對科學的興趣罷了。